隋軍在疏勒國中的大清洗引起疏勒政壇很大的震蕩，但實際上並不影響底層百姓的生活。
秦瓊很清楚，對待這些番人，要「打一棒給個甜棗」，于是在清洗之後，先是減免疏勒國中百姓一年的賦稅，又廢除了阿彌厥當政其間的苛政、暴政，並處置了一批基層民怨極大的貪官污吏。老百姓可不管當權的是誰，就看誰給你帶來好處，于是隋軍很快便得到疏勒國百姓的擁戴。
到了這個時候，大隋根本不需要扶植代理人，而是直接赤膊上陣。
大清洗沒涉及到阿彌厥，但整個疏勒王室也被清洗個七七八八。
秦瓊以幫助阿彌厥學習大隋文化為由，將阿彌厥一家送往輪台，包括其他一些不適合清除但也不適合留在疏勒的人員，全部送往輪台。與其他幾個送到輪台的國王一樣，以後他們再也回不到疏勒了。
阿彌厥此時是砧板上的魚肉，任人宰割。而且阿彌厥也不是什麼有氣節的君主，再是無奈忿恨，但為了保住小命，只得听之任之。
處置完疏勒王室，隋軍在在其地堂而皇之地設置官府。黃明遼從都護府下令，將疏勒國分置達滿、演渡、遍城三縣，並置疏勒軍鎮，以秦瓊兼任鎮戍使，置兵八千人。
西域三鎮安撫招討司隨之改為西域四鎮安撫招討司。
疏勒軍鎮西北從北疏勒山口通往熱海，西面則是蔥嶺阻隔河中和吐火羅，西南則可通過大小罽賓（迦濕彌羅）進入天竺諸國，東南則可直達女國，可謂是西域的要道。
整個西域的貿易，都要從這里經過。
大隋控制了這里，西可進入河中，威脅西突厥月復地；西南可連接吐火羅，繞開西突厥，直接與波斯等國聯系；南可進入天竺，開拓南亞次大陸；東南可進入羌塘之地，威脅未來將要崛起的吐蕃。
最最重要的是，大隋在天山以南的防線，最關鍵的西面一環，徹底閉環了。
秦瓊佔領疏勒之後，身邊便還剩兩個小國，一個是朱俱波，另一個則是喝盤陀。
朱俱波在疏勒的東南方向五百里，亦名朱居盤國，漢代時叫子合國，乃西域古國。現在的朱俱波是北涼詛渠家族之後所建，王為疏勒人，都葉城（今新疆葉城縣），算是疏勒、于闐的一個共同屬國。不過朱俱波國勢不弱，有兵上千人，而且其國受西突厥影響很大，國內上下皆是親西突厥派掌權。
大隋佔領疏勒之後，曉諭四方。朱俱波卻因為政治傾向，故意不與大隋接觸。
秦瓊乃派使節前往朱俱波，令其投降。
大隋連疏勒、龜茲這種大國都半滅亡了，自是不會留朱俱波這種小國存在，而且還是個不知死的小國。
為了能徹底佔領此地，秦瓊故意命使節劉煥之裝作狂悖無禮的樣子，激怒對方。劉煥之到了朱俱波，當場發難，狠狠地羞辱了朱俱波國王一番，還要朱俱波國內速速投降，否則必盡誅之。
朱俱波國王果然被激怒，拒不投降，還命人將隋使驅逐。倒不是朱俱波講禮儀，不斬來使，而是劉煥之身邊帶了五百騎兵，朱俱波人根本就不敢輕舉妄動。
秦瓊得信之後，心中大喜。
他早就命大將賀潤率隋軍一千，疏勒兵兩千在朱俱波國境外準備，就是為了等一個出兵的機會。現在朱俱波給了大隋這個機會。
朱俱波擔心隋軍出兵，便緊急動員國內百姓。但他們沒有料到，隋軍來的如此之迅速。朱俱波本就是一個小國，面積狹小，人口不多，也沒有什麼縱深。
所以隋軍急進，一路直襲朱俱波國都之下。
三千人馬，或許並不多。但一夜之間，突然出現在城下，對于城中上下的震撼是無法言表的。就連原本似乎態度強硬、意志堅定的朱俱波國王此時也慌了神。
整個朱俱波國上下，更是亂作一團。
賀潤頭天到達城下，第二日便率軍發起了攻擊。隋軍一鼓作氣，猛攻朱俱波城。
弓弩是守城利器，同樣是攻城利器。
隋軍用密不透風的強弓勁弩壓得朱俱波軍在城頭上抬不起頭。而附從的疏勒軍則趁機蟻附攻城。
賀潤不懼傷亡，晝夜不息地攻打城池。到了第二日下午，終于為隋軍攻上城牆，殺入城中。
朱俱波國王帶著一眾親信退入內城。
賀潤眼看對方據守，又下令士兵集中城中的柴火，全部堆積到內城城牆之下，然後讓人點起火來。
大火彌漫，沿著城牆燒了起來。隋軍又在外以弓弩戒備，敢有探出頭來救火的，盡被弓弩射死。
于是內城之中的守軍，是焦頭爛額，惶惶不可終日。
最後朱俱波國王實在撐不住了，只得派人出城投降，朱俱波遂下。
朱俱波本是小國，無論是實力還是影響力皆是有限。大隋直接以抗拒王師為由，廢除了國王，又在其地置磧南縣，歸屬疏勒軍鎮管轄。
至于朱俱波國中，敢于抵抗的都死在了隋軍攻城之中，往後這里便是大隋的順民之地。
隋軍佔領了朱俱波，把目光又放在了蔥嶺的喝盤陀。
蔥嶺之地，是西域之中隆起的一片高地，溝通西域四面八方。既是屏障，也是阻礙。所以在蔥嶺之上的喝盤陀變成了要害之地。
喝盤陀（今新疆塔什庫爾干塔吉克自治縣一帶）也是一個西域小國，有城十二，其在漢時國名蒲犁。居民從事農牧業，有文字，信佛教，人勁悍，王自稱「漢日天種」，常坐金床理事。喝盤陀有勝兵千人，國王也是疏勒人。
無論是朱俱波還是喝盤陀，雖離疏勒更近，但外貌、語言皆與于闐相同，同時又受天竺影響深重。
疏勒既下，而喝盤陀還為突厥人所控制。突厥人也明白此地的重要性，專門在此置兵以守衛。
秦瓊佔領疏勒之後，便命人傳信喝盤陀投降。當然這次是真正的勸降，畢竟喝盤陀和朱俱波情況不同。但喝盤陀人不僅不降，大隋前往喝盤陀的使節也直接被突厥人所殺。
秦瓊听聞之後，勃然大怒，乃親率兩千漢兵和三千疏勒兵西征喝盤陀。