時周法尚遠在洛陽未到，而從瀘州順江而下的黃明聰帶領三千劍南士兵，一路疾馳南下，直趨交州。
當時南征大軍因為主帥劉方病逝，又久不得回鄉，因而士氣低落，只有長史敬德亮在軍中勉強約束眾人。
黃明聰率軍到達交州之後，因周法尚未至，遂暫代軍中主帥。黃明聰治軍軍令嚴明整肅，軍容齊整，有違犯軍令的人必被斬首；同時又對士卒仁慈愛護，士兵患病他親自撫慰關照，士兵皆願為之效命。
當時上開府秦雄隨軍重病，不能視事。黃明聰見其病危，難以痊愈，一時流淚不已，又親自照顧秦雄。南征將士遂感受到黃明聰的仁心，因此黃明聰盡得南征將士軍心，劉方舊將秦雄、宋纂、何光、嚴願等人皆為之用。
黃明聰原本是準備等待主帥周法尚南下之後再行出兵，可他在交州待了沒有多久，便接到了尚在林邑沒有歸還的行軍司馬李綱的求援。
當時劉方北上之後，便留了一部兵馬于比景，並命李綱在此戍之，處理林邑方面的事務。當初，尚書右丞李綱因為幾次有不同意見違逆了楊素和蘇威，楊素就向文帝推薦李綱，讓他作劉方的行軍司馬。劉方是楊素的舊部出身，深得楊素信賴，也懂得楊素派遣李綱前來的用意。他幾次尋釁，趁機侮辱李綱，而李綱幾乎被劉方致死。
這一次李綱更是被劉方置于了死地。
劉方去後，林邑國王梵志去而復返，乃引重兵圍困比景港。李綱此時手上不過兩千余嶺南士兵，困守比景港，孤立無援，只得向交州求援。
當時主帥周法尚不到，軍中無人能做主，因此接到李綱的求援眾人皆不知所措。李綱是劉方帶人排擠的，因此在軍中也沒人與他親近，此時更無人開口要救援李綱。
黃明聰知道比景港是隋軍在林邑最後一塊根據地，也是二次征伐林邑的前進基地，不能丟失，因此救援李綱一事不得耽擱。
黃明聰乃力排眾議，決定提前出兵征討林邑。
黃明聰的身份本來沒資格作為大軍主帥，但其作為黃明遠的堂弟，在朝中有黃明遠為其撐腰，再加上其這些日子在軍中不斷收攏人心，因此無人違逆。
黃明聰乃率領所部並劉方舊部共計九千余人，又匯合驩州刺史李暈，並征調位于嶺南的大將軍張愻所部，緊急趕往比景港。
黃明聰所部一路推進，大軍進駐安遠縣，直逼北上的林邑軍主力。
實際上這一次的林邑兵較之之前，戰力差了不少。之前劉方第一次南征，幾乎將林邑主力全殲，林邑國數十年積蓄全落到劉方手中。這一次林邑國王梵志卷土重來，雖然看起來兵力充足，來勢洶洶，不弱之前，但實際上都是一群烏合之眾。
黃明聰前鋒不到兩千人，林邑之兵見黃明聰所部人少，乃聚而圍之。為了振奮隋軍士氣，黃明聰乃命副將楊弘禮率軍擊敗林邑軍的前鋒，斬首數千。又與李暈合軍進攻交谷城（今越南河靜省河靜以南）。
交谷城是林邑在橫山以北最後的據點，兵力充足。
黃明聰故意只命楊弘禮率少量部隊攻城，而假裝把主力進攻他處，以麻痹林邑軍。而暗中黃明聰則命心月復蒯雲烈等人率敢死士，每人都持火炬和銅角，在夜間四鼓時分，越過重壕，用雲梯登城。
猛將宋纂一馬當先，先登入城，士卒們也紛紛蟻附而上，然後吹響號角，萬炬齊舉。城下軍隊吶喊而進，有如雷霆之勢，遂攻進城中。七界
隋軍攻破交谷城，重創了林邑軍的士氣。
此時林邑國王梵志又使出了殺手 象兵部隊，準備攻擊進擊的隋軍。
黃明聰用畫成的獅子蒙在馬上沖擊，又故意敲鼓，並以眾弩擊殺大象。林邑軍的大象都返身退走，林邑軍大部潰敗。
此戰黃明聰斬首七千余級，俘獲無算，幾乎全殲了林邑殘余的主力部隊。
失去軍隊的梵志又驚又懼，乃率兵南逃。黃明聰率兵繼續猛攻，一路追擊到大緣江，將其沿江木柵盡毀，再次俘虜和斬殺無數林邑軍。
黃明聰進軍如有神助，乃窮追不舍，乘勝攻破林邑國都，並安撫官民和歸附者，來歸順的人每天以萬計。
此次黃明聰為了防止梵志去而復返，便命楊弘禮、宋纂、何光三人追擊梵志，並擊破了林邑各處的援兵。
梵志倉皇失措，焚燒宮室倉庫後逃到海上。他本來以為這一次又能像之前一般逃月兌，卻沒想到黃明聰早料到梵志兵敗後會出海，因此命麾下大將張鎮州率領舟師伏于林邑以東的海上。
等到梵志出海之後，張鎮州發現對方的痕跡，立刻出擊，于海上擊敗梵志殘部，並擒殺梵志。
至此林邑國始平。
黃明聰進軍如旋風一般，實在太快了。等到周法尚趕到交州，黃明聰就只給他留下了一個已經平定的林邑。
捷報傳到洛陽，楊廣大喜，黃明遠趁機勸楊廣遷部分漢民于此，使林邑之地，永入大隋。
楊廣乃以黃明遠的建議施行。
為了更好的經營南方，楊廣又以周法尚為交州刺史，兼任交州安撫大使，負責經營交趾和林邑。
命黃明聰為開府儀同三司，蕩州刺史，代管農州、沖州二地。林邑雖然設置了三州十二縣，但基層官吏全無，三州的班子也根本拉不起來，吏部也沒辦法配齊上百人去林邑為官，因此只得使最靠北的蕩州代管農州、沖州二地，至于屬縣，只有一個典沖城。
而長史沈映則被任命為驩州刺史。
黃明遠又趁機表自己的表弟崔仁翰為交趾令，至此整個越南之地，基本上落入黃明遠的手中。
黃明遠乃給堂弟黃明聰去信，自己會令資源向林邑傾斜，命其向南攻略瀾滄水三角洲的野人部落，發展農業，儲蓄糧食。而黃明遠也會從大隋內陸向林邑移民。
林邑本身自然條件優越，雖然不是王霸之基，但開發好了，又是一個小江南。未來北方爭霸，林邑承擔著輸血的作用。而哪怕北方爭霸真的失敗了，但狡兔三窟，林邑也將是家族在南方的一條退路。