張長遜、焦方杰二人，攻克涪州之後，逆流而上，很快趕到渝州城下。
此時二人尚不知曉渝州城的情況，也不知道權氏和黃氏的仇怨，于是便按部就班地派人前往城中勸降。沒想到權文誕不僅不降，還殺了明軍使節，揚言決死一戰。
張、焦二人大為憤怒，立刻下令強攻渝州城。
無論是張長遜還是焦方杰，二人都是宿將，多經戰陣，也算是無往不勝。因此對于一個小小的渝州城，並不放在眼中。
可很快，渝州城就給了二人一個回應。
明軍連續攻打渝州城及其周圍的營寨三日，皆被唐軍擊退。
這給了張長遜和焦方杰二人當頭一擊。
二人有些不解，城中守軍不過五千，如何有這麼強的戰斗力。
權文誕雖然只有五千人，但渝州本就是權氏家族的老巢。為了抵御明軍，城中所有的權家人都出動。這些權氏部曲、私兵，本就是同仇敵愾，更兼佔據地形優勢，自然打起來戰斗力就強了。
連攻三日不順，張長遜和焦方杰也嚴肅起來。
此時焦方杰認為，頓兵堅城之下，乃是失策之舉，不若留少量軍隊困擾之，而以主力沿長江而上，先取瀘州，支援成都戰場。等大勢已定，再回攻渝州。
一個小小的渝州城，並不影響大局。
但張長遜不同意。
在張長遜看來，明軍遠道而來，本就沒有完全佔領各地，投降的唐軍也是各懷鬼胎。若是繞過渝州，一旦後方生變，很可能便是月復背受敵的局面。
明軍諸將，也多贊同張長遜。
水師和左御衛二部一同出擊，雖然左御衛兵多，但張長遜資格老，官爵亦高，所以黃維揚在二人出擊前，以張長遜為主，焦方杰為副。
十一月十四日，張長遜親督諸軍攻渝州城。
次日明軍先後從「一字」城牆、西門、東門三個方向出擊，攻打渝州城。同時又派遣水軍，繞到北面的朝天門，從水上發起攻擊。
明軍充分發揮了兵多的優勢，開闢了數個戰場，使唐軍陷入疲于奔命的境地。
可權文誕不愧號稱是「閻羅總管」，就是個十足的瘋子。
為了御敵，他竟然將老百姓趕到城牆之上，逼著明軍殺人。而明軍只要一有所猶豫，權文誕就發動反擊。
明軍的紀律，讓他們沒法繼續向前。
而權文誕借著此計，連續奪回陣地。
而且令人沒有想到的是，似乎老天爺也不幫著明軍。
十一月十八日，焦方杰親自率軍，趁夜突襲「一字」城牆。一字城牆又叫橫城牆，其作用在于阻礙城外敵軍運動，同時城內守軍又可通過外城牆運動至一字城牆拒敵，與外城牆形成夾角交叉攻擊點。
只有奪取此地，才能取得此戰的主動權。
面對明軍的 攻，權文誕不得不親自率部據戰。
此時的明軍士氣如虹，幾乎打得守軍抵擋不住。眼看明軍便要奪下城牆，這時突然天降大雨，阻止了明軍的攻擊。
渝州地形，本就多為山地，崎區不平，不易攻擊。再加上大雨導致的泥濘，攻擊變得更加不順。
大雨連下了三日方止，而唐軍借著這三日的大雨，很快修補城牆，穩定了城防。等到明軍再次發起攻擊之後，唐軍早就準備妥當了。
明軍自巫山之戰後，沿途所經過的城池寨堡，多因唐軍守將投降而輕易得手，其實尚未踫上一場真正的硬仗。所以這一仗，一開始便犯了輕敵的毛病，等到明軍開始重視起這一戰，又因為各種各樣的原因，影響了攻城。
盡管明軍戰船之上，攜帶了大量的攻城器具，而且多十分精備，奈何渝州城地勢險峻，這些攻城器械根本不能發揮作用。
雙方激戰到二十四日，明軍已經被渝州城阻隔了十日。
此時所有人都開始急躁了。
十日的時間，對于一場攻城戰來說，其實並不長，但卻像是當頭棒喝一般，打得明軍恍神。明軍經過連續的勝利，已經有些上頭了。
這時候焦方杰再勸張長遜繞過渝州，先取戎州，仍被張長遜拒絕。
對于張長遜來說，渝州不下，是對三軍士氣一個重要的打擊，所以硬著頭皮也得攻克此地。
而且明軍西進，沿途城池望風而降，本就是這些人對明軍畏懼的一個體現。可若是此戰不勝，打破了明軍的不敗金身，接下來其他州縣若是跟著渝州城有樣學樣，那明軍一城一地的打，什麼時候是個頭。
所以非得徹底拔除渝州，誅殺權文誕，才能給巴蜀的反抗勢力一個巨大威懾。
這時降將秦武通主動請纓。
秦武通投降之後，便跟著明軍水師一起行動。
雖然是被迫投降，可是秦武通的覺悟還是不低的。要想有個安穩的晚年，現在就得要立功，否則戰事結束，他這個級別的將領，真沒人會注意。
于是張長遜便讓秦武通帶著千余降兵攻打渝州城。
秦武通到了渝州城下，高聲呼道︰「兄弟們以後是虎是蟲，就在今日。」說完之後，秦武通便一馬當先，爬上雲梯，冒著飛石，向城牆爬去。
秦武通驍勇，竟一口氣登上城牆。
很快大批的唐軍便圍了上來，秦武通帶著部下亦陷入苦戰之中。
秦武通和唐軍激戰半個時辰，傷亡慘重，秦武通本人也受傷，不得不退軍。
這時秦武通的兒子秦士元代請父親出征，繼續作為先鋒，率領所部精銳攻擊城牆。可惜秦士元力戰良久，終因後援不繼，被迫撤還。
至此，這一戰徹底陷入僵局。
十一月三十日，左御衛左副總管侯莫陳乂親自率部前往渝州城下搦戰。
侯莫陳乂往日跟權文誕相識，便在城下高聲喊道︰「權文誕，我來活汝一城性命，你何必執迷不悟！」
就在此時，城內投石機轟然一炮，飛石正好擊中侯莫陳乂的頭部，侯莫陳乂被砸的落馬，鮮血淋灕，被眾人抬回後，便于當夜身死，時年四十五歲。
侯莫陳乂也是軍中老將，跟隨黃明遠十多年，封一等伯。今日侯莫陳乂身死，導致明軍士氣大降，這一仗，更不好打了。